molecular epidemiology of foot-and-mouth disease virus in ruminant during 2005- 2006 in iran

[ ' f o o t a n d m o u t h d i s e a s e ( f m d ) i s a h i g h l y c o n t a g i o u s v i r a l d i s e a s e o f r u m i n a n t w h i c h c a u s e s f e v e r a n d p o s t u l e o n m o u t h ' , ' h o o f a n d t e a t . t h e m a i n p u r p o s e o f t h i s s t u d y w a s t o d e t e r m i n e a n d c h a r a c h t r i z e i s o l a t e d f m d v i r u s f r o m i r a n b e t w e e n 2 0 0 5 ' , 2 0 0 6 , ' a n d t o c o m p a r e i t w i t h v a c c i n e v i r u s s t r a i n s . a f t e r p r e p a r a t i o n o f s a m p l e s ' , ' s e r o l o g i c a l t e s t f o r t y p i n g o f v i r u s w a s p e r f o r m e d . i n o r d e r t o v i r u s i s o l a t i o n ' , ' t h e s a m p l e s w e r e i n o c u l a t e d t o i b r s 2 c e l l ' , ' r t ' , ' p c r a n d p c r w e r e u s e d f o r s e q u e n c i n g . t w o d i m e n t i o n a l v i r u s n e u t r a l i z a t i o n t e s t w a s c a r r i e d o u t f o r d e t e c t i n g o f i m m u n o l o g i c a l r e l a t i o n s h i p ( r v a l u e ) b e t w e e n t h e f i e l d i s o l a t e a n d v i r u s p r e s e n t e d i n v a c c i n e . d e t e c t e d s t r a i n s w e r e a s f o l l o w s : 2 4 1 s a m p l e s o f t y p e a 0 5 i r ' , ' 1 2 5 o f t y p e a 8 7 i r ' , ' 7 9 o f t y p e 0 ' , ' 3 o f t y p e a s i a a n d 7 1 4 n e g a t i v e o u t o f 1 1 6 2 s a m p l e s . a v e r a g e r ' , ' v a l u e s o f t y p e a ' , ' o ' , ' a s i a f i e l d v i r u s w i t h v a c c i n e s t r a i n s w e r e 5 0 ' , ' 9 2 % a n d 9 7 % ' , ' r e s p e c t i v e l y . p h y l o g e n i c t r e e w a s d e s i g n e d a c c o r d i n g t o t h e n u c l e i c a c i d s e q u e n c i n g d a t a . t h e r e i s n o t s t r o n g r e l a t i o n s h i p b e t w e e n f i e l d v i r u s e s o f t y p e a a n d v a c c i n e v i r u s e s . h o w e v e r a s t r o n g r e l a t i o n s h i p w a s s h o w n f o r t y p e 0 a n d a s i a o n e s w i t h v a c c i n e v i r u s s t r a i n s . ' ]